OpenMx asennus Windows 7

OpenMx -paketti ei toimi (ainakaan toistaiseksi) Windows 7 alla, ks. keskustelu:

http://openmx.psyc.virginia.edu/thread/2071

Ongelmana on R:n versio 3.0, jotta OpenMx toimisi, niin pitäisi asentaa R 2.15 versio. Mutta tämä taas ei liene mahdollista Survo R:n osalta?

Periaatteessa OpenMx:n saa asennettua R:n komennolla:
source('http://openmx.psyc.virginia.edu/getOpenMx.R')

Petri Palmu wrote

OpenMx -paketti ei toimi (ainakaan toistaiseksi) Windows 7 alla, ks. keskustelu:

Uudemmassa viestissä lupailevat käännetyn binääriversion parin viikon kuluessa, joten ehkä voisit odotella sen aikaa.

Petri Palmu wrote

Ongelmana on R:n versio 3.0, jotta OpenMx toimisi, niin pitäisi asentaa R 2.15 versio. Mutta tämä taas ei liene mahdollista Survo R:n osalta?

Kyllä Survo R toimii ihan hyvin R 2.15.x:n kanssa, mutta uusimmille versioille ei ole käännetty vanhan R:n huolimia binääripaketteja. Eli ratkaisu olisi sama kuin OpenMx:n saaminen toimimaan R 3.0.x:n kanssa nyt heti eli lähdekoodeista kääntäminen.

<quote author="Reijo Sund">

Petri Palmu wrote

OpenMx -paketti ei toimi (ainakaan toistaiseksi) Windows 7 alla, ks. keskustelu:

Uudemmassa viestissä lupailevat käännetyn binääriversion parin viikon kuluessa, joten ehkä voisit odotella sen aikaa.

Juu voin toki odotella (en huomannutkaan tuota viimeisintä tietoa :)

Asensin tuota Openmx:ää varten, joka ei vieläkään pelitä R 3.0. versiolla, R 2.15.1 version. Asennuksen jälkeen, kun käynnistin Rgui:n, niin se yritti hakea automustea. Mikäköhän syynä? Survo R:hän ei taida toimia kuin 3.0. -> versioilla?


R version 2.15.1 (2012-06-22) -- "Roasted Marshmallows"
Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.

R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

Loading required package: automuste
During startup - Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘automuste’
>

Ja kuin kokeilin tollla /RACT  R-skriptien aktivointisukrolla, niin tuli error:

Loading Tcl/Tk interface ... done
Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'muste'
Calls: sys.load.image ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted


Ajatuksenani on siis käyttää Survo R:n sisällä R 2.15.1 vanhan Survon tapaan (aktivoimalla skriptejä sukroilla /RACT , /RTERM). Toki sama onnistuu myös Survolla, mutta tarkoitus on pikkuhiljaa siirtyä kokonaan Survo R:ään.

Petri Palmu wrote

Asensin tuota Openmx:ää varten, joka ei vieläkään pelitä R 3.0. versiolla, R 2.15.1 version. Asennuksen jälkeen, kun käynnistin Rgui:n, niin se yritti hakea automustea. Mikäköhän syynä? Survo R:hän ei taida toimia kuin 3.0. -> versioilla?

Survo R:n kyllä toimii "takaperin yhteensopivasti" ainakin R:n versioon 2.8.0 asti, jos sen kääntää itse lähdekoodeista. Valmiiksi käännettynä binaaripakettina se on kuitenkin Survon sivuilla tarjolla vain uusimpaan versioon.

Ja automustetta R yrittää etsiä todennäköisesti siksi, että se löytää käynnistyshakemistostasi .Rprofile-tiedoston. Koita vaihtaa käynnistyshakemistoa tai poista tuo häiritsevä .Rprofile.

Reijo Sund wrote

Survo R:n kyllä toimii "takaperin yhteensopivasti" ainakin R:n versioon 2.8.0 asti, jos sen kääntää itse lähdekoodeista. Valmiiksi käännettynä binaaripakettina se on kuitenkin Survon sivuilla tarjolla vain uusimpaan versioon.

Ja automustetta R yrittää etsiä todennäköisesti siksi, että se löytää käynnistyshakemistostasi .Rprofile-tiedoston. Koita vaihtaa käynnistyshakemistoa tai poista tuo häiritsevä .Rprofile.

Okei kiitos, olin unohtanut tuon .Rprofilen, kun se lienee enemmän mennyttä aikaa :)

Petri Palmu wrote

Okei kiitos, olin unohtanut tuon .Rprofilen, kun se lienee enemmän mennyttä aikaa :)

Ei tuo ole oikeastaan mennyttä aikaa, kun automuste luo .Rprofilen automaattisesti..

Reijo Sund wrote

Ei tuo ole oikeastaan mennyttä aikaa, kun automuste luo .Rprofilen automaattisesti..

No juu tajusin tuon kun olin poistanut .Rprofilen... ja sitten Survo R ei avautunut. Mutta asensin automusteen uudelleen ja sitten Survo R toimi taas normaalisti. .Rprofilen poiston jälkeen R 2.15.1 alla ajetut skriptit alkoivat toimia. Eli homma näyttäisi pelittävän niin kuin toivoin :)